食品科學技術學院是河南農業大學重點發展的學院之一。1987年，經國家教委批準，在農學系設農產品貯運與加工專業。1994年11月，學校進行專業調整，撤系建院，成立生物工程學院。2001年12月，撤銷生物工程學院，成立生物技術與食品科學學院。2005年1月，成立食品科學技術學院。
學院擁有一支團結、敬業、拼搏、創新的高水平師資隊伍，現有教職工87人，教授和副教授35人，國家產業技術體系崗位科學家1人，河南省學術技術帶頭人1人，河南省政府特殊津貼專家2人，河南省教育廳學術技術帶頭人4人，省高校青年骨干教師5人，省高層次人才5人。近年來，學院承擔國家“十三五”和“十四五”重點研發計劃項目、國家自然科學基金、河南省重大科技專項等國家級與省級科研與教研項目80余項。通過省級評價成果30余項，獲河南省科技進步二等獎4項，三等獎3項，獲批國家專利60余項，發表論文1000余篇，其中SCI、EI收錄300余篇。
學院積極加強對外交流，在業界具有較強的影響力，先后加入了國家肉類產業技術創新戰略聯盟、國家速凍產業技術創新戰略聯盟、國家食藥同源產業科技創新聯盟;積級與企業開展合作，服務地方經濟發展。教學工作中，按照“學生中心、產出導向、持續改進”的基本理念開展教學工作，積極推進“產教融合、協同育人”的實踐教學模式，與雙匯集團、三全食品、統一企業、河南省農科院等知名食品企業與科研機構共建實習基地20余個。學生的工程實踐能力與綜合素養得到了行業的高度評價。
在建設“雙一流”大學的進程中，學院以成為對區域食品科學技術發展有重要支撐作用的教學研究型學院為目標，以人才培養為根本，立足河南，面向全國，搶抓機遇，積極進取，不斷開創學院發展新局面。