植物保護學科肇始于20世紀初，1910年廣東農林試驗場開始病蟲害防治試驗，開啟了具有現代意義的植物保護研究。1918年廣東公立農業專門學校開設昆蟲學課程（包括害蟲防治學），是國內最早開設該課程的七個學校之一。1924年廣東大學設立的農藝學系下分農藝、園藝、蠶桑、畜牧、病蟲害、農業經濟等6門，其中的“病蟲害門”即為植保系的前身。1939年中山大學農學系分設農藝、園藝和病蟲害三組，1948年病蟲害組擴建為系。同期，嶺南大學農學院設植病系。1952年中山大學病蟲害系、嶺南大學植病系、廣西大學植保系（部分）調整到華南農學院農學系。1953年8月經高教部批準，成立植保系，設植保專業。1996年植保系、國土資源與環境科學系合并組建資源環境學院，2015年植物保護學科整體劃入農學院，2020年7月植物保護學院成立。植物保護學科歷史悠久，學術積淀深厚，學科發展過程中涌現出大批知名專家學者，戴芳瀾院士、鄧叔群院士、張巨伯教授、陸大京教授、尤其偉教授、涂治院士、趙善歡院士、蒲蟄龍院士、龐雄飛院士、林孔湘教授、范懷忠教授等為學科創立和發展做出了卓越貢獻。

學院辦學特色鮮明，綜合實力較強。1978年被批準為碩士學位授權點，1984年被批準為博士學位授權點，1998年被批準為我國首批一級學科博士學位授權點，1999年獲批我國第一批博士后流動站，所屬的農業昆蟲與害蟲防治是國家重點學科，植物病理學是農業部和廣東省重點學科，農藥學是廣東省重點學科。植物保護專業于2007年入選國家特色專業，2013年被遴選為廣東省攀峰重點學科，2015年入選國家卓越農林人才培養計劃，2018年被遴選為廣東省高水平大學重點建設學科，2019年獲批國家一流本科建設專業。

學院師資力量雄厚，科教成果豐碩。現有專任教師84人，其中獲得博士學位者81人，有海外留學訪學經歷者76人，國家級人才6人次，省級人才52人次。農藥學系教工黨支部是省級“第三批樣板黨支部”，植物病理學系教工黨支部2021年被省委教育工委、省教育廳評為 “先進基層黨組織”。現有省級實驗教學示范中心1個，全國重點實驗室1個，教育部、農業農村部、廣東省重點科研平臺9個，省部級校內外教學基地5個。近五年，主持國家重點研發專項計劃1項，國家自然科學基金重點項目7項，其他國家和省部級課題220余項，總經費3.06億元；在Cell、Nature Communications、PNAS、Nature Microbiology等刊物發表ESI收錄論文1088篇，授權發明專利243件，轉化應用21件，出版學術著作18部，獲國家級和省部科技獎勵10項，在微生物通訊、害蟲成災新模式、作物致病新機制、新農藥創制、生物多樣性與生物防治、精準施藥等方面取得了重要研究成果，為煙粉虱、紅火蟻、實蠅、草地貪夜蛾、香蕉枯萎病等外來入侵物種的可持續控制,為柑橘黃龍病、南方水稻黑條矮縮病、蔬菜根結線蟲病、番木瓜病毒病、荔枝霜疫霉等重要作物病蟲害的綠色防控做出了重要貢獻。

學院堅持育人為本、德育為先，全面落實立德樹人根本任務，吸引了大量優質生源，培養了大批高素質人才，已累計培養了包括4名中國科學院院士在內的8000余名畢業生，分布于全國各地以及30余個國家和地區，許多優秀學子已成為行業翹楚、業界精英，為我國現代化建設做出了重要貢獻，為世界農業發展貢獻了植保力量。學院目前開設“植物保護”本科專業，設植物保護“丁穎創新班”和“智慧植保”方向；招收植物病理學、農業昆蟲與害蟲防治、農藥學、微生物學專業的碩士生/博士生，招收資源利用與植物保護領域的農業專業碩士。現有全日制在校生1578人，其中本科生765人，研究生813人（博士研究生99人、碩士研究生697人、留學生17人）。現有國家級一流本科課程4門，廣東省一流本科課程6門，建設3門省級在線開放課程，近五年獲首屆全國教材建設獎一等獎和二等獎各1部，全國農業教育優秀教材2部，第二屆全國高校教師教學創新大賽正高組一等獎。學生專業基礎扎實,綜合素質較高，近四年本科生升學率穩居學校前列，2024屆本科應屆生升學率達58.76%（含出國深造），4名研究生榮獲廣東省優秀學生（研究生階段）。近5年來學生主持和參加國家級和省級創新創業項目115項(人)，獲第十八屆“挑戰杯”全國大學生課外學術科技作品競賽揭榜掛帥專項賽特等獎和二等獎、第六屆中國國際“互聯網+”大學生創新創業大賽銀獎、“挑戰杯”中國大學生創業計劃競賽銀獎、“互聯網+”創業大賽廣東省賽銀獎等，植物保護博士生黨支部獲首批“全國高校百個研究生樣板黨支部”，農藥學系碩士研究生黨支部獲學校第三批“樣板支部”立項。學院重視國際化教育，現有8名全職外籍教師，招收全英文授課研究生，與38個國家和地區54所高校和研究機構建立合作關系，近5年來有共有84名研究生赴康奈爾大學、華盛頓大學、東京大學等聯合培養。

歷經百余年的發展，植物保護學院已經構筑了完備的學科建設和人才培養體系，成為我國植物保護高級人才培養中心、理論技術創新中心和成果應用轉化中心。今后學院將按照“1335”總體布局，即“圍繞1個核心目標、建設3個學科方向、突出3大優勢、聚焦5大領域”，以我國熱帶南亞熱帶有害生物可持續控制為核心目標，立足華南，服務全國，面向國際，以國家戰略和現代農業重大需求為導向，按植物病理學、農業昆蟲與害蟲防治、農藥學三個方向建設，突出群體感應、綠色防控、生物農藥三大優勢，重點聚焦微生物群體感應通訊、有害生物綠色防控、生物防治與生物農藥、生物入侵與生物安全、導向農藥與智慧植保等五大領域，培養符合國家戰略需求，具有寬廣的國際視野、深厚的專業功底、良好的信息處理能力和管理組織能力，身心健康，掌握當代植物保護理論和核心技術，創新能力突出的領軍型高級專門人才，為我國社會經濟發展，服務鄉村振興、粵港澳大灣區建設和“一帶一路”倡議貢獻華農智慧、植保力量。學院全體師生將繼續堅持以學科建設為龍頭，以人才培養為根本，產學研協調發展，在國內外同仁支持下，不忘初心，牢記使命，守正創新，為建設國內一流、國際有顯著影響力和競爭力的研究型學院努力奮斗！