水利水電學院源自1952年建立的水力發電系、水工結構系和水利土壤改良系，1954年，水力發電系和水工結構系合并為河川系，1958年，水利土壤改良系改名農田水利工程系，1985年，河川系改名水力發電工程系。1995年，以水力發電工程系、農田水利工程系和水利水電科學研究所為基礎組建了水利水電工程學院。2009年，更名為水利水電學院，2018年，農田水利工程系、農業水土工程研究所、農業環境研究所及相關學科從水利水電學院劃出。

　　學院設有水利水電工程系、水工結構研究所、水力學及河流研究所、水利水電工程研究所和水利工程博士后流動站。學院現有水力學及河流動力學、水工結構工程、水利水電工程以及水利水電建設與管理四個二級學科，其中，水力學及河流動力學、水工結構工程和水利水電工程為國家重點學科；擁有4個二級博士學位授權點和1個專業碩士學位授權點，分別為水力學及河流動力學、水工結構工程、水利水電工程、水利水電建設與管理博士學位授權點及土木水利專業碩士學位授權點。以我院學科為主要支撐的水利工程學科是國家首批211工程重點建設學科、國家一級重點學科、國家優勢學科創新平臺建設學科，2008、2012和2016年全國學科評估均為第一。2010年和2014年連續入選江蘇優勢學科建設工程，2017年水利工程學科入選國家“雙一流”建設學科。本科專業為水利水電工程。教育部水利水電工程安全工程研究中心、南京市土工合成材料工程技術研究中心均掛靠學院。本院還是“水文水資源與水利工程國家重點實驗室、水資源高效利用與工程安全國家工程研究中心”和“水安全與水科學省部共建協同創新中心”的主要建設學院。

　　學院現有教職工108人，其中專任教師81人。專任教師中，教授35人，副教授39人。博士生導師42人、碩士生導師88人。專任教師博士學位比例達92.5%。同時，學院還聘請雙聘院士3人，兼職博士生導師29人，兼職教授34人。學院有中國工程院院士1人，國家、省部級創新團隊2支，海外高層次人才計劃4人、“長江學者”特聘教授1人，“杰出青年基金獲得者”2人，萬人計劃2人，“新世紀百千萬人才工程”國家級人選3人，江蘇省特聘教授5人，江蘇省雙創計劃3人，“江蘇省杰出青年基金獲得者”3人，江蘇省“333高層次人才培養工程”突出貢獻獎2人，江蘇省“333工程”培養對象第一層次1人、第二層次3人、第三層次4人，江蘇省“青藍工程”培養對象10人，江蘇省六大人才高峰4人，霍英東教育基金會高等院校青年教師獎1人、青年教師基金3人。全國模范教師2人，江蘇省名師1人，寶鋼特等獎1人，優秀獎4人 ，江蘇省十佳研究生導師團隊1支。

　　學院有博士研究生330人，碩士研究生1036人，其中學術型碩士生415人，專業學位碩士生208人，非全日制專業學位碩士生413人，本科生678人，留學生80人。

　　學院發揮水利學科優勢，先后承擔了國家重點研發計劃項目，國家自然科學基金重點項目等重大國家級研究課題，參與研究并解決了三峽、南水北調、溪洛渡、水布埡、錦屏、小灣等國家重大水利工程的關鍵技術難題。近年來，學院積極參與“一帶一路”水利工程建設，在贊比亞下凱富峽、馬來西亞巴貢、剛果英布魯和巴基斯坦真納等水利工程的科研工作中做出了貢獻。學院積極服務于水利生產建設，每年承擔100多項各類水利工程生產項目的研究及咨詢。近五年來，學院科研經費達3.1億元，發表SCI論文400多篇，出版專著10部；獲國家科技進步獎4項，省部級科技進步獎46項，授權發明專利500多項。