上海財經大學碩士研究生的學習年限一般為2-3年。其中工商管理碩士02和03方向、公共管理碩士、會計碩士11方向、工程管理碩士等專業或研究方向學習年限為2.5年,西方經濟學04方向、數量經濟學02方向、金融碩士06、07和12方向、應用統計碩士05方向、國際商務碩士03方向、法學理論、法律史、憲法學與行政法學、刑法學、民商法學、訴訟法學、經濟法學、環境與資源保護法學、國際法學、法律碩士(非法學)、法律碩士(法學)03方向、基礎數學、應用數學與計算科學、概率論與數理金融、最優化與控制、應用概率、軟件工程技術、軟件服務工程、軟件工程理論與計算復雜性、金融領域軟件工程、會計碩士02方向等專業或研究方向學習年限為3年,其他專業或研究方向學習年限均為2年。
專業學位碩士的課程設置以綜合素養和應用知識與能力的提高為核心,突出應用性;培養過程主要強調理論和實踐相結合,強調基礎理論、方法和技術在實際工作中的應用;重視案例分析、模擬訓練和現場研究,側重對學生解決實際問題能力的培養;強化實踐環節,至少有半年以上的時間到具體工作崗位進行實踐;實行雙導師制,由大學導師和來自實際一線部門專家共同培養和指導,充分體現適應性,為學生未來的就業打下堅實的基礎。