為全面對接、融入和服務國家戰略及自治區經濟社會發展需要，進一步理順工作機制，加強內涵建設、提升辦學水平，打造特色優勢明顯、質量品牌突出的專業學位研究生教育體系，擴大社會影響力，加快學校事業發展，新疆大學于2020年4月成立商學院。商學院主要面向國家和自治區經濟社會發展主戰場和人民群眾需求，培養黨政部門、企事業單位高級管理人才。

  商學院現有工商管理碩士（MBA）、會計碩士（MPAcc）、工程管理碩士（MEM）、旅游管理碩士（MTA）、公共管理碩士（MPA）5個管理類專業碩士學位。新疆大學商學院主要依托新疆大學理論經濟學（博士點）、工商管理（碩士點）、機械工程（博士點）、建筑學（碩士點）、土木工程（碩士點）、公共管理（碩士點）、信息與通信工程（碩士點）等學科和相應研究平臺，科學高效地整合經濟與管理學院、建筑工程學院、智能制造現代產業學院（機械工程學院）、交通運輸工程學院、信息科學與工程學院、旅游學院、政治與公共管理學院等相關教學資源和師資力量，開展管理類專業學位碩士研究生培養，形成以教授、副教授和具有博士學位的專任教師為主、兼具較強科研能力和豐富實踐經驗的校內校外相結合的“雙師型”師資隊伍。